水際対策

入国時感染症ゲノムサーベイランスの概要

2023年5月8日から検疫所では入国時感染症ゲノムサーベイランスを行っています。

入国時感染症ゲノムサーベイランスの結果

• 入国時感染症ゲノムサーベイランス結果（2023年5月）（2023年７月13日更新）［379KB］
• 入国時感染症ゲノムサーベイランス結果（2023年6月）（2023年８月10日更新）［943KB］
• 入国時感染症ゲノムサーベイランス結果（2023年7月）（2023年10月５日更新）［919KB］
• 入国時感染症ゲノムサーベイランス結果（2023年8月）（2023年10月５日更新）［1.5MB］
• 入国時感染症ゲノムサーベイランス結果（2023年9月）（2023年11月２日更新）［1.1MB］
• 入国時感染症ゲノムサーベイランス結果（2023年10月) （2023年11月30日更新）［455KB］
• 入国時感染症ゲノムサーベイランス結果（2023年11月) （2023年11月30日更新）［311KB］

結果についての補足

• 本調査で検出可能な感染症（病原体遺伝子）は「入国時感染症ゲノムサーベイランスで検出可能な病原体」をご確認ください。
• 一つの検体から複数の病原体が確認される場合があります。
• 本調査において検出された病原体は、被検者に常在する病原体の可能性もあり、症状を引き起こしている病原体とは必ずしも一致しません。
• 新型コロナウイルスのゲノム解析におけるPANGO系統の判定はNextclade及びPangolinを用いて解析を行い、両方で適正に判定された検体を最終判定に資する対象としており、判定不能となった検体については「ND」(Not Determined)と表記しています。
• Nextclade及びPangolinの判定プログラムは随時更新されていることから、後日系統分類が変更される可能性があります。
• 個別の結果についての問い合わせには対応していません。
• オミクロンの下位系統の説明についてはこちらをご確認ください［286KB］。

入国時感染症ゲノムサーベイランスで検出可能な病原体

本調査で検出可能な病原体遺伝子は以下のとおりです。

• 新型コロナウイルス
• アデノウイルス
• コロナウイルス（229E、HKU1、OC43、NL63）
• ヒト・メタニューモウイルス
• ライノウイルス/エンテロウイルス
• インフルエンザウイルスA
• インフルエンザウイルスA（A-H1-2009、A/H1、A/H3）
• インフルエンザウイルスB
• パラインフルエンザウイルス（１～４）
• RSウイルス
• 百日咳菌（Bordetella pertussis）
• パラ百日咳菌（Bordetella parapertussis）
• クラミジア・ニューモニエ（Chlamydophila pneumoniae）
• マイコプラズマ・ニューモニエ（Mycoplasma pneumoniae）