| コード番号 | 重点研究分野 | 研究区分 | コード番号 | 重点研究分野 | 研究区分 | |
| 101 | ライフサイエンス | ゲノム | 501 | エネルギー | 化石燃料・加工燃料 | |
| 102 | ライフサイエンス | 医学・医療 | 502 | エネルギー | 原子力エネルギー | |
| 103 | ライフサイエンス | 食料科学・技術 | 503 | エネルギー | 自然エネルギー | |
| 104 | ライフサイエンス | 脳科学 | 504 | エネルギー | 省エネルギー・エネルギー利用技術 | |
| 105 | ライフサイエンス | バイオインフォマティクス | 505 | エネルギー | 環境に対する負荷の軽減 | |
| 106 | ライフサイエンス | 環境・生態 | 506 | エネルギー | 国際社会への協力と貢献 | |
| 107 | ライフサイエンス | 物質生産 | 589 | エネルギー | 共通基礎研究 | |
| 189 | ライフサイエンス | 共通基礎研究 | 599 | エネルギー | その他 | |
| 199 | ライフサイエンス | その他 | 601 | 製造技術 | 高精度技術 | |
| 201 | 情報通信 | 高速ネットワーク | 602 | 製造技術 | 精密部品加工 | |
| 202 | 情報通信 | セキュリティ | 603 | 製造技術 | 高付加価値極限技術(マイクロマシン等） | |
| 203 | 情報通信 | サービス・アプリケーション | 604 | 製造技術 | 環境負荷最小化 | |
| 204 | 情報通信 | 家電ネットワーク | 605 | 製造技術 | 品質管理・製造現場安全確保 | |
| 205 | 情報通信 | 高速コンピューティング | 606 | 製造技術 | 先進的ものづくり | |
| 206 | 情報通信 | シミュレーション | 607 | 製造技術 | 医療・福祉機器 | |
| 207 | 情報通信 | 大容量・高速記憶装置 | 608 | 製造技術 | アセンブリープロセス | |
| 208 | 情報通信 | 入出力（注） | 609 | 製造技術 | システム | |
| 209 | 情報通信 | 認識・意味理解 | 689 | 製造技術 | 共通基礎研究 | |
| 210 | 情報通信 | センサ | 699 | 製造技術 | その他 | |
| 211 | 情報通信 | ヒューマンインターフェイス評価 | 701 | 社会基盤 | 異常自然現象発生メカニズムの研究と予測技術 | |
| 212 | 情報通信 | ソフトウエア | 702 | 社会基盤 | 災害被害最小化応用技術研究 | |
| 213 | 情報通信 | デバイス | 703 | 社会基盤 | 超高度防災支援システム | |
| 289 | 情報通信 | 共通基礎研究 | 704 | 社会基盤 | 事故対策技術 | |
| 299 | 情報通信 | その他 | 705 | 社会基盤 | 社会基盤の劣化対策 | |
| 301 | 環境 | 地球環境 | 706 | 社会基盤 | 有害危険・危惧物質等安全対策 | |
| 302 | 環境 | 地域環境 | 721 | 社会基盤 | 自然と共生した美しい生活空間の再構築 | |
| 303 | 環境 | 環境リスク | 722 | 社会基盤 | 広域地域研究 | |
| 304 | 環境 | 循環型社会システム | 723 | 社会基盤 | 水循環系健全化・総合水管理 | |
| 305 | 環境 | 生物多様性 | 724 | 社会基盤 | 新しい人と物の流れに対応する交通システム | |
| 389 | 環境 | 共通基礎研究 | 725 | 社会基盤 | バリアフリー | |
| 399 | 環境 | その他 | 726 | 社会基盤 | ユニバーサルデザイン化 | |
| 401 | ナノテク・材料 | ナノ物質・材料（電子・磁気・光学応用等） | 789 | 社会基盤 | 共通基礎研究 | |
| 402 | ナノテク・材料 | ナノ物質・材料（構造材料応用等） | 799 | 社会基盤 | その他 | |
| 403 | ナノテク・材料 | ナノ情報デバイス | 801 | フロンティア | 宇宙科学（天文を含む） | |
| 404 | ナノテク・材料 | ナノ医療 | 802 | フロンティア | 宇宙開発利用 | |
| 405 | ナノテク・材料 | ナノバイオロジー | 821 | フロンティア | 海洋科学 | |
| 406 | ナノテク・材料 | エネルギー・環境応用 | 822 | フロンティア | 海洋開発 | |
| 407 | ナノテク・材料 | 表面・界面 | 889 | フロンティア | 共通基礎研究 | |
| 408 | ナノテク・材料 | 計測技術・標準 | 899 | フロンティア | その他 | |
| 409 | ナノテク・材料 | 加工・合成・プロセス | 900 | 人文・社会 | ||
| 410 | ナノテク・材料 | 基礎物性 | 1000 | 自然科学一般 | ||
| 411 | ナノテク・材料 | 計算・理論・シミュレーション | ||||
| 412 | ナノテク・材料 | 安全空間創成材料 | ||||
| 489 | ナノテク・材料 | 共通基礎研究 | ||||
| 499 | ナノテク・材料 | その他 | ||||
| 注 | 研究区分番号２０８の入出力とは、情報通信システムの入出力を容易にする技術をいう。ただし、研究区分番号２０９から２１１までに該当するものを除く。 |