| 担当課 | |||
| [行政政策研究分野] | |||
| 1 | 政策科学推進研究経費 | 政策統括官政策評価官室 内線７７７８ | |
| 2 | 厚生科学特別研究費 | 大臣官房厚生科学課 内線３８０９ | |
| 3 | 統計情報高度利用総合研究費 | 大臣官房統計情報部人口動態・保健統計課保健統計室 内線７５０５ | |
| 4 | 社会保障国際協力推進研究経費 | 大臣官房国際課 内線７２９５ | |
| [総合的プロジェクト研究分野] | |||
| 1 | がん克服戦略経費 | 健康局総務課生活習慣病対策室 内線２３３９ | |
| 2 | 長寿科学総合研究経費 | 老健局総務課 内線３９０８ | |
| 3 | 障害保健福祉総合研究経費 | 社会・援護局障害保健福祉部企画課 内線３０２０ | |
| 4 | 子ども家庭総合研究経費 | 雇用均等・児童家庭局母子保健課 内線７９３７ | |
| 5 | ヒトゲノム・再生医療等研究経費 | ||
| ヒトゲノム・遺伝子治療研究 | 医政局研究開発振興課 内線２５４３ | ||
| 再生医療研究 | 健康局疾病対策課 内線２３５６ | ||
| バイオテクノロジー応用食品 | 医薬局食品保健部監視安全課 内線２４５２ | ||
| 6 | ２１世紀型医療開拓推進研究経費 | ||
| ＥＢＭ研究分野 | 医政局研究開発振興課医療技術情報推進室 内線２５８８ | ||
| がん研究分野 | 健康局総務課生活習慣病対策室 内線２３３９ | ||
| 心筋梗塞・脳卒中研究分野 | 医政局指導課 内線２５５８ | ||
| 生活習慣病（がん、心筋梗塞、脳卒中を除く）研究分野 | 健康局総務課生活習慣病対策室 内線２３３９ | ||
| 痴呆研究分野 | 老健局総務課 内線３９０８ | ||
| [先端的厚生科学研究分野] | |||
| 1 | 脳科学研究経費 | 健康局疾病対策課 内線２３５６ | |
| 2 | 高度先端医療研究経費 | ||
| 治療機器等開発研究分野 | 医政局研究開発振興課 内線２５４３ | ||
| 人工血液開発研究分野 | 医薬局血液対策課 内線２９０３ | ||
| 3 | 新興・再興感染症研究経費 | 健康局結核感染症課 内線２３８７ | |
| 4 | エイズ対策研究費 | 健康局疾病対策課 内線２３５７ | |
| 5 | 感覚器障害及び免疫アレルギー等研究経費 | ||
| 感覚器障害研究分野 | 社会・援護局障害保健福祉部企画課 内線３０２０ | ||
| 免疫・アレルギー等研究分野 | 健康局疾病対策課 内線２３５６ | ||
| 6 | 特定疾患対策研究経費 | 健康局疾病対策課 内線２３５６ | |
| [健康安全確保総合研究経費] | |||
| 1 | 生活安全総合研究経費 | 医薬局食品保健部企画課 内線２４５２ | |
| 2 | 医薬安全総合研究経費 | 医薬局総務課 内線２７０８ | |
| 3 | 健康科学総合研究経費 | 健康局総務課地域保健室 内線２３３４ | |
| 4 | 創薬等ヒューマンサイエンス総合研究経費 | 医政局研究開発振興課 内線２５４３ | |
| 5 | 医療技術評価総合研究経費 | 医政局総務課 内線２５２０ | |