11．カンピロバクターの型別法
　
　<I>C. jejuni</I>と<I>C. coli</I>の感染ルートや原因食品を明らかにするための疫学調査の目的で行われる型別には、血清型、ファージ型、遺伝子型などがある。それぞれの方法には一長一短があり、検査の規模、予算、設備、時間などに応じて使い分けがなされている。
　
血清型
　血清型は<I>C. jejuni</I>と<I>C. coli</I>を型別する方法として最も広く用いられている。現在ではPennerとLiorの2種類の型別法が世界的に受け入れられている。Pennerの血清型は耐熱性（heat stable; HS）抗原を用いた受身血球凝集反応による型別法で、Liorの血清型は易熱性（heat labile; HL）抗原を用いた菌体凝集反応に基づいた型別法である。両型別法の最大の欠点は、分離株を型別した場合に多数の型別不能株が生じること、使用する抗血清が限られた施設でしか利用できないことである。このことは、型別を行うには抗血清が不十分であること、カンピロバクターの抗原の多様性によることが原因となっている。また、特異血清を作製するにはコストがかかり、一定の品質を保つのに労力を要する。
　
ファージ型
　<I>C. jejuni</I>と<I>C. coli</I>でファージ型別が行われているが、型別する能力は低い。
　
遺伝子型
　遺伝子型別の利点は、血清型別とは異なり、どの試験室においても実施することが可能で、得られた情報を交換することが可能である。遺伝子型別法のうちflagellin typing(fla typing)、リボタイピング、パルスフィールドゲル電気泳動による型別（PFGE typing）は、多くの試験室ですでに利用されている。今後の課題として、試験方法を統一して標準化し、国際的なハーモナイゼーションを図ることが望まれる。すでにEU諸国では、インターネット上でこれらの問題を提起し、標準化とハーモナイゼーションを図る試みがなされている
（CAMPYNET: http://www.svs.dk/campynet）。
1）	Flagellin typing (fla typing)
　<I>C. jejuni</I>の鞭毛蛋白をコードする遺伝子（flaA、flaB）は直列に配列しており、塩基配列が高度に保存された領域と、変化に富んだ領域が存在するため、鞭毛遺伝子はPCR-RFLP（polymerase chain reaction based restriction fragment length polymorphism）法により型別するのに適している。さまざまな方法が報告されており、実施方法の統一が必要である。多数の野外株の鞭毛遺伝子の塩基配列の解析が行われており、共通プライマーを設定することが可能となってきた。
2）パルスフィールドゲル電気泳動による型別（PFGE typing）
　ゲノムDNAを制限酵素で消化した後にアガロースゲル内で電気泳動したバンドを解析する方法で、PFGE typingはサブタイピングの方法として広く用いられている。最も一般的に使用されている制限酵素はSmaIであるが、KpnIのような酵素と併用することで型別能は顕著に増加する。実施方法を標準化することで研究室間の差はなくなってきている。
3）リボタイピング
　カンピロバクターの染色体DNAには3つのrRNAのコピーが存在する。rRNA遺伝子内にある塩基配列の不変領域とそれに隣接する可変領域があるので、サブタイピングをするのに適している。ゲノムDNAを制限酵素で消化し、rRNAに特異的なプローブを用いたサザンハイブリ代ゼーションによって行う。本法の欠点は、結果を得るまでに時間がかかること、操作が煩雑であること、コピーが3つしかないので、型別能に乏しいことである。
4）その他の遺伝子型別法
　その他の遺伝子型別法として、Random amplified polymorphism DNA (RAPD)法、Amplified fragment length polymorohism (AFLP)法、塩基配列決定法などがある。RAPD法は10塩基程度のランダムな塩基配列からなるプライマーを用いて行うPCRで、操作法は簡便であるが再現性が乏しい。AFLP法の型別能は優れているが、コストがかかり、操作が煩雑で実施するのに熟練を要する。