論文 No.：83
タイトル：Evaluation of phenotypic method for subtyping Cmpylobacter jejuni isolates 
　　　　　from humans,poultry, and cattle.
筆頭著者：NIELSEN E.M.
論文、年、Vol、頁（〜）：J.Clinic.Microbiol 38:3800-3810 (2000)
個表分類：疫学・型別
　
<ITEM1> \n調査の目的
 
デンマークにおいて、ヒト、鶏、ウシから採取された90検体の<I>C.jejuni</I> に対し6つの型別判別方法を実施し、その判別能を比較検討した。
　
<ITEM2> \n検体名
 
ヒト（発症者）と汚染水、ブロイラー、ウシ、発症者以外のヒト由来の保存検体：ヒト由来の検体は発症者から単離され保存されていた菌株。ブロイラーおよびウシ由来の菌はそれぞれ処理場での健康畜の糞便由来：ヒトから分離された40菌株、ブロイラーから分離された20菌株、ウシから分離された15菌株,患者から分離された9菌株、水から分離された2菌株、患者以外から分離された4菌株,それぞれは-80度で保存されていた。
　
<ITEM3>
 
ヒト（発症者）と汚染水、ブロイラー、ウシ、発症者以外のヒト由来の保存検体：ヒト由来の検体は発症者から単離され保存されていた菌株。ブロイラーおよびウシ由来の菌はそれぞれ処理場での健康畜の糞便由来：ヒトから分離された40菌株、ブロイラーから分離された20菌株、ウシから分離された15菌株,患者から分離された9菌株、水から分離された2菌株、患者以外から分離された4菌株,それぞれは-80度で保存されていた。
　
<ITEM4>
 
カンピロバクター
　
<ITEM5>
 
血清型別検査、PFGE、RiboPrinting、RAPD、fla-RFLP、fla-DGGEの6方法。冷凍保存されていた菌株は血液寒天培地を用い42度で24時間から48時間微好気培養し、増菌し使用。血清型別検査は47の<I>C.jejuni</I>および19の<I>C.coli</I>の抗血清を用いた。PFGEはGibsonらの方法に準じた。Fla-RFLPはflaA遺伝子の1.7kbフラグメントを増幅し、DdeIプロファイルとAluIプロファイルを比較した。RAPDはReady-To-Go RAPDビーズを使用したPCR法であり、3つのプライマーから増幅される遺伝子を比較した。
　
<ITEM6>
 
RAPDならびにPFGEが最も型別能が優れていた。次ぎにfla-RFLPならびにRiboPrintingが優れていた。血清型別検査およびfla-DGGEは最も判別能が劣っていた。RAPDならびにPFGEでは80菌株が50以上のタイプに型別された。fla-RFLPならびにRiboPrintingでは80菌株が40のタイプに型別された。一方、血清型別検査およびfla-DGGEでは20以下のタイプにしか型別不可能だった。特に、血清型別で同じ複合型とされたものでも、RAPDならびにPFGEではそれぞれが異なる型として判別することが可能であった。
　
<ITEM7>
 
Nielsen EM, J Clin Microbiol 38, 3800
　
<PUBMED>

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/htbin-post/Entrez/query?form=4&db=m&Term=Nielsen EM, J Clin Microbiol 38, 3800